Percy, pour son année scolaire de premier secondaire dans sa nouvelle école se trouve un nouvel ami, Tyson, mais alors qu'il jouait à la balle au prisonnier, à la fin de l'année, il se fit attaquer par une bande de Cannibales sous formes adolescentes. Il partit à la colonie des Sangs-Mêlés avec Tyson et Annabeth. Il apprend là-bas que les limites de la colonie se sont très affaiblies car quelqu'un a empoisonné le pin de Thalia, limite magique de la Colonie. Son ami Grover, parti pour sa quête du Dieu Pan, est en danger. Chiron a été renvoyé par Dionysos qui l'accuse d'avoir empoisonné le pin de Thalia et c'est Tantale, un ancien détenu des enfers, qui le remplace. Percy découvre que Tyson est un cyclope lorsque son père, Poséidon, revendique celui-ci comme son fils. Il décide de prendre une quête pour trouver la Toison d'Or, qui est supposée guérir le pin de Thalia. Tantale refuse et accorde la quête à Clarisse, fille d'Arès. Aidé par Hermès, Percy s'enfuit de la Colonie avec Annabeth et Tyson à bord du Princesse Andromède, le bateau dans lequel vogue l'armée de Luke, son vieil ennemi, à l'aide d'Hippocampes (ici, moitié chevaux et moitié Poissons) envoyés par Poséidon. Il arrive à s'enfuir dans les canots de sauvetages et rejoint les côtes de Virginia Beach où il affronte et tue l'Hydre de Lerne.
Après la bataille, Percy rencontre Clarisse à bord de son bateau, le Birmingham, rempli de morts-vivants. Clarisse veut affronter Charybde, le cyclone meurtrier, mais lorsque que le bateau passe à côté de Charybde, sa sœur Scylla attrape Percy et le sauve de l'explosion du Birmingham. Lorsqu'il se débarrasse de Scylla, il se rend compte qu'il a perdu Clarisse et Tyson.
Percy et Annabeth arrivent sur l'île de Circé qui lui fait boire une potion et le transforme en cochon d'Inde. Annabeth le sauve puis ils s'enfuient à bord d'un bateau pirate. Ils passent près de l'île des Sirènes dans laquelle Annabeth s'enfuit mais se fait rattraper par Percy. Ils arrivent à l'île du cyclope Polyphème où ils retrouvent Clarisse et Grover. Ensemble, ils affrontent le cyclope avec Tyson et récupèrent la Toison d'Or. Au dernier moment, Polyphème fait couler leur bateau, et ils réussissent à rejoindre Miami grâce à des hippocampes envoyés par Poséidon. Clarisse revient à la Colonie seule avec la Toison d'Or (Percy reconnait que c'est la quête de Clarisse et la laisse retourner à la Colonie pour avoir son moment de gloire). Percy, Grover, Annabeth et Tyson se font capturer par Luke au moment où Clarisse prend le taxi. À bord du Princesse Andromède, Percy envoie un message Iris à Dionysos pour lui prouver que Chiron était innocent dans l'affaire du pin de Thalia. Luke, énervé par l'entêtement de Percy, se bat contre lui. Mais alors que Percy est en mauvaise posture, les cousins de Chiron, des centaures, attaquent l'armée de Cronos et délivrent Percy et ses amis. Percy et Annabeth vont ensuite rencontrer les sirènes ou Percy attache Annabeth autour d'un mat pour qu'elle puisse entendre le récit des sirènes alors que Percy se bouche les oreilles de cirre. Ces trois la vont alors atteindre l'ile du cyclope ou ils le tuent et récupère la magnifique toison d'or. Ils rejoignent la Colonie et mettent la Toison d'Or sur le pin de Thalia. L'arbre ainsi que la colonie sont sauvés, cependant la magie de la Toison va au-delà de toute espérance. En effet, cela entraine la résurrection de Thalia, fille de Zeus.